Entre 1961 et 1976, environ 114 000 tonnes de déchets spéciaux issus de l’industrie chimique bâloise (bci), du Canton de Berne et de l’armée suisse ont été entreposés dans une ancienne glaisière dont la surface avoisine les 20 000 m2.
De 1982 à 1994, la décharge a été rendue étanche grâce à un couvercle en argile. De larges mesures de sécurisation complémentaire (système de drainage, station d’épuration) ont été prises afin de réduire au minimum les impacts de la décharge sur l’environnement.
En 2000, les représentants du Canton du Jura et de la bci ont signé une convention sur l’assainissement total de la décharge industrielle de Bonfol (DIB).
Sur la base d’une étude de variantes réalisée en 2001, le projet d’assainissement définitif de la décharge a été décidé en 2003 conformément à l’Ordonnance sur l’assainissement des sites pollués.
Les travaux de préparation ont débuté en septembre 2007, en 2017 la halle d'excavation a été démolie et le site renaturé.